外債の償還差損益については、償還金をドルで受け取る場合も、為替差損益を含めた円貨ベースで計算されます。

例えば、２年前、為替レートが１ドル１４０円で、米国債１００ドル（額面）を９９ドルで取得。今年７月、１ドル１６０円で償還を迎える場合、
ドルベースの償還差益は、償還金１００ドル－取得金額９９ドル＝１ドルですが、税務上の償還差益は、円換算した償還金額－取得金額で計算されます。
すなわち、
償還金額（円）　償還金額１００ドル×為替レート１６０円＝１６０００円
取得金額（円）　取得金額　９９ドル×為替レート１４０円＝１３８６０円
税務上の償還差益  　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　２１４０円

譲渡益税は、償還差益２１４０円×税率２０％＝４２８円となります。

償還金をドルで受け取る場合は、為替差益を実現していない時点での課税ですので、違和感があります。すなわち、ドルベースでは償還差益は１ドル（１６０円）なのですが、譲渡益税を４２８円支払うことになるからです。

なお、譲渡益税の支払いは、ドルで受け取る場合も、円で支払います。

特定口座（源泉徴収あり）を選択し、かつ償還差益が発生している場合
　償還金を円で受け取る場合：償還金額より譲渡益税が源泉徴収されます。
　ドルで受け取る場合：円の預り金から譲渡益税が源泉徴収されます。